1999年，曾在廣告業工作的陳肇偉回來接管家業，他把所學的行銷及經營方式導入這間老書店，「我從小在店裡長大，以前的管理真的很糟糕，書這裡一堆那邊一堆，要補書就得把書搬出來看欠哪一本，賣量久了也會忘記。」當時雙親仍以手寫帳本的方式記帳，「我決定用電腦來幫助管理，後來竟然發現，光華商場雖然在賣電腦，卻沒有一家在做Pos（Point of Sale；銷售時點情報系統）。」
Pos是目前廣泛運用在各大零售業的電子系統，可以統計商品的銷售、庫存與顧客的購買行為，當時在光華商場還沒有人使用。陳肇偉決定在書店導入Pos系統，同時實施會員制度，並架設網站，來做讀者的客製化需求，「早期跟客人接觸時，發現他們對出版日期有迫切的需求，常來問哪本書什麼時候出，所以決定建立一個平台，讓客人知道他們想要的書已經來了。」
陳肇偉以email告知讀者相關的新書資訊，「客人非常依賴email來買書，尤其是現在出版周期拉長，買一本書的機會更少，他就更需要這個資料。」建立消費資料庫後，也幫助書店精準採購，減少不必要的開銷；另外陳肇偉本身就愛看漫畫，加上其海派、能跟客人打成一片的性格，成功打響蛙蛙書店名號。
書市慘澹 有對策卻一籌莫展
多年來實體書市慘澹，蛙蛙書店生意如今已從最高峰掉了7成。面對大環境不佳，陳肇偉也不是沒有對策，「我15年前就知道要做網購，但對手是大的網路商城，真的很難做起來。」他以博客來為例，「399免運費、書本79折，怎麼跟他拚？」後來也曾想做網拍，「那個價格更恐怖，75折，因為任何人都可以做，都可以拚價錢。」陳肇偉表示，現在實體書店的優勢剩下「安全感」，「還是有些客人會希望在實體店看到、摸到書，然後買回家。」
幾年前台灣興起「複合式」風潮，他也曾在書店2樓打造「蛙蛙漫吧」，結合餐飲，讓客人可以在店內看漫畫、吃東西，但效果欠佳。「本來想說客人買了漫畫就上去看，可是我發現他們對這種消費是苛刻的，常點一杯飲料從早坐到晚。」陳肇偉笑說，店內一餐都100多元，客人坐到一半就會跑去吃40元的雞肉飯。
面對數位浪潮，他也曾雇用年輕人來想辦法，「我一直有找人，可是我發現我的管理能力不足以駕馭他們。」陳肇偉自認是一位威嚴的老闆，以前每天早上要跟員工開檢討會，下屬做不好也會罵人，卻給他們過大壓力，「我後來發現這不對，因為新一代要的是『一起』的感覺，我一直沒有做好這一點。」
當年那位用新科技打響蛙蛙書店的年輕人，如今年過半百，也有追不到時代車尾燈之感，「科技進步太快，像我這種50幾歲的，你叫我去玩ig、玩facebook，真的沒辦法。」他嘆：「當時我贏在敢導入新東西，可是當我年紀大了，現在卻敗在沒有持續接觸年輕人的東西。」
