指揮中心指出，自12月1日至明年2月28日（啟程地時間），入境我國機場或經我國機場轉機的旅客，不論為本國籍或外國籍、來台目的，均應檢附「表訂登機時間前3日（工作日）內COVID-19核酸檢驗陰性報告」，始可登機來台；若旅客檢驗報告不實，或拒絕、規避、妨礙相關檢疫措施，得依法處以新台幣1萬元至15萬元罰鍰，並追究相關刑責。
秋冬時期除了武漢肺炎外，亦有多種呼吸道傳染病盛行，指揮中心表示，為降低呼吸道傳染病的感染與傳播，及避免過度耗用醫療資源，自12月1日起，強制要求民眾進入「醫療照護、大眾運輸、生活消費、教育學習、觀展觀賽、休閒娛樂、宗教祭祀、洽公」等8大類場所應配戴口罩，違者經勸導不聽，可處新台幣3,000元至1萬5,000元罰鍰。
指揮中心補充，如在上述場所內有飲食需求，在保持社交距離或有適當阻隔設備情況下，可在飲食期間暫時取下口罩；指揮官陳時中進一步說明，室外場所仍以勸導為主，8大類室內場域則是強制執行。
醫療應變方面，指揮中心研擬4大措施，包括醫療院所落實法定傳染病通報義務、訂定「加強門診與急診社區感染肺炎病人篩檢」「加強住院病人篩檢」及「強化醫療照護人員健康監測」等獎勵通報採檢指標、透過健保系統提醒加強通報採檢、修訂無武漢肺炎相關症狀居家隔離及檢疫者之採檢及相關處理流程。
陳時中表示，雖然目前沒有確切研究指出武漢肺炎病毒在什麼條件下較為活躍，但依照推論室內通風與否與病毒傳播高度相關，因此列出8大類室內要戴口罩的場所，並指出全球疫情正升溫，希望能把最基本的防線做好。
