日前悠遊卡公司新任總經理邱昱凱薪資曝光，引發外界關注，柯文哲去年底拍板的「市府主管並捐助成立基金會行政法人及6大公司董事長執行長總經理副執行長薪資及獎金發放原則」指出，悠遊卡投控及悠遊卡公司董事長、總經理的薪資不得高於北捷同級的薪資，因此邱昱凱的薪資比照北捷總經理，同樣是16.4萬元；但外界盛傳，北市府有後門條款，邱昱凱可透過該條款但書利用「專案核准」的方式，照領月薪25萬元。
由於邱昱凱的薪資問題爭議不斷，據《ETtoday》報導，邱昱凱已與柯文哲達到共識，並不會引用但書特例，薪資仍比照北捷總經理的薪資。
報導稱，目前邱昱凱仍維持原職的薪資，升任總經理後的薪資預計在6月悠遊卡公司董事核准後，屆時再補。據悉，北市府已定調，上報的薪資金額會用全年薪資不超過200萬元為上限，除以14個月下來，月薪約14萬元左右。
