藍營人士說，黨中央原本考慮嚴審連署門檻，還考慮發給有投票權的黨員每人1組條碼，讓參選人以條碼認證，確保連署不會重複，但該做法在參選人馬激增後，洪陣營立即改弦更張，改為放寬連署門檻，「辦法怎麼訂，都是洪的人馬在主導，目標就是鎖定第一假想敵吳敦義。」
另一方面，黨員名冊遲遲不給擬參選人也讓黨中央備受抨擊。由於主席選舉2月13日開放領取連署表格，擬參選人開始連署，不過，國民黨90多萬黨員的名冊，只有黨中央掌握，部分地方黨員已收到黨中央拜票簡訊，但其他候選人卻要等到4月6日才能拿到，洪陣營提早偷跑，再成挑戰洪的參選人箭靶。
值得注意的是，主席洪秀柱是唯一在登記前，即擁有黨員名單的候選人，所以，不只吳敦義大罵不公不義，副主席郝龍斌也痛批黨中央讓候選人瞎子摸象。藍營人士批評，非現任的其餘5組候選人，只能在各縣市設立連署站徵求連署書，但黨員在哪裡？沒名冊的人只能各憑本事找，沒投票權的連署人也會被剔除，光是連署就大費資源，洪擺明一副「裁判加上主辦、協辦所有的單位，全部都是我的人，怎麼和我鬥？」
