中研院不僅退還唐獎基金會2,000萬元捐助金，不再負責評選工作，設在中研院的唐獎辦公室也已悄悄搬空，連諾貝爾獎得主李遠哲都辭去評選總召集人，大動作切割勢必重創唐獎的光環。
3月24日本刊實地到蔡元培館訪察，發現設於2樓的唐獎基金會評選辦公室確實早已人去樓空，院內工作人員透露，不久前，唐獎基金會委託的搬家公司，趁著週末人少時，將所有文件資料全部搬回台北市八德路上的潤泰集團總部，5人評選小組撤離中研院，正式結束與中研院的合作關係。
中研院副院長黃進興向本刊記者證實，已決定終止和唐獎的合作關係，並另訂新約，讓唐獎基金會自行試辦第3屆評選，「看看成效如何後，再決定第4屆和第5屆評選，是唐獎自辦或回到由中研院負責。」至於唐獎基金會承諾每年捐1,000萬元研究經費給中研院，當做中研院承辦評選的回饋金，黃進興表示，日前已將2,000萬元退還給唐獎基金會，唐獎辦公室租金收入也已歸還。
黃進興強調，包括諾貝爾獎在內，都有建立一套評選得獎者的制度，唐獎一直由中研院負責評選並非長久之計，建立制度後，再廣邀重量級學者參與是比較好的做法，中研院院士屬於榮譽職，只要唐獎有意邀請中研院的學者參與，都會站在支持的立場放行，但不會再走回中研院主導的角色。
本刊調查，當時簽訂唐獎合約時，中研院承諾負責評選工作10年時間，一共要評選出5屆得獎者，合作才剛完成第2屆，並邁入第4年就突然終止，對唐獎的光芒確實將有所減損。
