2015年，「英國藍」連鎖茶飲店有多項茶品原料被驗農藥超標，全台共有96家加盟店業者被迫關店。目前英國藍自救會已請律師向總部提起民事求償，試圖尋求最後的解套方法。加盟主們痛批政府始終未正視加盟產業，放任加盟總部以「不合理的定型契約」處理加盟業者與合作廠商的關係。
而另一家知名的飲料業者清玉茶飲，也在2013年時引發爭議，飲料被驗出含糖量過高後，加盟主與加盟總部也隨即引爆糾紛。有加盟主出面指控，清玉總部故意不與加盟主續約，甚至要拉高加盟金，還在附近開新的加盟店等手段搶生意。雖然清玉總部出面澄清，卻也連帶影響部分加盟店的生意，最後只好拉下鐵門結束營業。
根據商業技術研究院的研究，這些合約糾紛可分類為加盟金糾紛、廣告不實、未充分揭露重要交易資訊等。加盟主若要與合作廠商簽訂完善的加盟契約，就必須明確地規範加盟總部和加盟店之間的權利、義務關係，才能真正避免合約糾紛產生。
