馬英九指出，在4月14日第一次開庭後，檢方提出補充理由書中，對大法官釋字585號解釋的適用範圍、適用對象、適用場合的見解充滿誤導、矛盾與本位主義，嚴重牴觸大法官釋字585號解釋意旨，這不僅是檢察官治國，更可能造成國政大亂的檢察官誤國。
馬英九指出，北檢在理由書中認為大法官585號解釋，不能包括刑事犯罪偵查及其指揮權限。因此總統的權限，不及於顯為司法屬性的資訊在內。但是何謂顯為司法屬性，以及如何區分「司法」與「非司法」資訊？由誰決定？北檢卻沒有說明，他認為，釋字585號解釋並未區分「行政資訊」或「司法資訊」，因此不論資訊的屬性為何，行政首長都有決定是否公開的行政特權。
馬英九認為，依大法官釋字585號解釋，總統可以決定是否公開犯罪偵查中的相關資訊，他並沒有主張總統可以指揮監督檢察機關或檢察官，他是被動接受有關立法院長與委員聯手關說司法個案的資訊，沒有要求檢察官提供，沒有干涉司法個案，更沒有主動指揮辦案。
馬英九指出，檢方認為，檢察首長可以享有行政特權，以對外公開偵查中應秘密的資訊，若此說法成立，那麼前檢察總長黃世銘向他報告立法院長與委員聯手關說司法個案，為何要被被起訴判刑？馬英九指出，依照北檢見解，檢察首長享有行政特權，那黃世銘前總長向他報告司法關說案當然就不構成洩密了，也不構成犯罪。
馬英九認為，黃世銘如果沒有洩密，他當然更沒有洩密或教唆洩密。因為他既然沒有洩密，北檢就應該立刻撤回對他的起訴，馬英九說，否則北檢起訴他的行為，可能構成《刑法》第125條的「濫權追訴處罰」罪。
馬英九指出，司改國是會議已決議研訂「妨害司法公正罪」，以杜絕司法關說，他說，民進黨大黨鞭柯建銘委員今天就在庭上，請檢察官不妨徵詢柯建銘的意見，問他是否願意帶頭登高一呼，提案修改《刑法》與《立法委員行為法》，馬英九說，他也會商請立法院國民黨團呼應，大家一起讓司法關說走入歷史，讓中華民國的司法更公正、更獨立；全案訂再開4次庭期，傳喚黃世銘等證人，預計7月7日審結。
