衛生局接獲馥宇行離職員工檢舉後，會同法務部調查局新北市調查處，前往該公司位於三重區的門市兼工廠，針對其芝麻原料、製造過程、進出貨等事項調查，發現牆壁不潔、天花板破損、無病媒消毒紀錄、無水塔清洗紀錄、無員工健康檢查紀錄和無定期衛生講習、訓練等多項缺失。
此外，衛生局還發現馥宇行的「黑芝麻醬」、「白芝麻醬」等主力產品，其產地標示、營養標示不符規定，已違反食品安全衛生管理法第22條、第47條，可處新台幣3萬元以上，300萬元以下罰鍰；必須限期回收產品改善，改善前不得繼續販賣。
更誇張的是，衛生局指出，馥宇行並沒有食品工廠登記證，根本就是地下工廠，將請主管單位經發局檢查判定。若經查證屬實，將勒令業者停業並食品衛生管理法移送法辦。
