林福來過去曾擔任過國科會科學教育發展處長4年時間，當時吳茂昆是國科會副主委，之後更接任主委，兩人之間培養出相當好的默契。知情人士透露，兩人的政治立場一致，都是屬於深綠學者，放棄退休生活重出江湖，主要是幫忙老長官分擔工作。
林福來長期關注數學教育，1994年在李遠哲科學教育基金會創辦時，李遠哲更親自邀請林擔任執行長，顯示與李遠哲之間的好交情，雖然專長是數學教育，但一直跟深綠學者走的很近，立場鮮明，這次被請出來救火，被視為是彌補吳茂昆對國民教育比較不熟悉的缺點。
本刊電話詢問林福來是否即將接任教育部政次，他低調表示：「不知道」但沒有否認此事。行政院發言人徐國勇則是表示，政次人選由部長決定，行政院不會干涉，雖然行政上還是要由行政院同意，但選擇副手人選則是完全尊重教育部。
不過林福來在陳水扁執政時期，與多位學者一起推動建構式數學，2002年時引起社會輿論不同意見的反彈，15年過去，這段時間林福來在台師大一手創辦數學教育中心，並推動數學奠基模組，為台灣數學教育的補救教學帶來很大影響。
去年林福來退休時，台師大數學系不只舉辦歡送會還舉辦研討會，連卸任的前教育部長吳思華都出席研討會致詞，顯示林福來在教育界的聲望。知情人士透露，請出已經年滿70歲的數學教育大老擔任教育部次長，可以看出吳茂昆有意在最短時間進入狀況坐穩位子推動政策。
