台北地方法院今4月11日裁定，劉伯恩在提供165萬元擔保金後，在董座之爭的民事官司判決確定前，都可繼續執行馬偕醫院董事長及董事職務，也禁止長老教會停止或解除劉的董事職務，劉伯恩暫時保住董座資格。
台北地院在今年4月24日，將裁准劉伯恩保住董座資格的公文送達長老教會，但長老教會認為不必遵守，仍另指派代表取代劉伯恩的位置，並選出蔡國民擔任馬偕醫院董座。
劉伯恩主張，他是在2015年11月15日經馬偕醫院董事會選為董事長，任期到今年11月14日，確無故遭以非法程序剝奪董座資格，新任董座因選任違法，無法執行董事長職務，導致新竹兒童醫院興建等重大業務延宕，嚴重損及民眾與醫院權益。
台北地院認為，今年4月已裁准劉伯恩可續任董座，但台灣基督長老教會總會卻不遵守，已違反強制執行法，裁處6萬元怠金。
另馬偕醫院向台北地院聲請變更法人代表案，日前也遭法院認定程序有問題而駁回，馬偕已聲明異議，正由法院審理中。
此外，馬偕醫院董事長之爭的法律攻防戰，也從地方法院打到行政法院。因馬偕醫院選出蔡國民後，衛福部許可馬偕將他解任，並補選蔡國明為新董事長，劉認為衛福部的行政處分違法，因此向台北高等行政法院聲請停止原處分執行，近日將開庭審理。
