檢方查出，馬英九欲帶領國民黨在2008年重返執政鋪路，當時余建新找上門時，告知中時集團財務狀況惡劣，已至生死攸關關頭，有意藉接手華夏公司持有的中視、中廣等媒體事業，協助中時媒體王國轉型發展。
由於張哲琛、汪海清為達成馬英九承諾黨政軍退出媒體經營，原本設定交易底線40億元，最後竟以21.5億元，將中投及光華名下持有的華夏公司股權全數移轉給余建新的榮麗公司。
關鍵是，馬英九等人竟然隱匿包括東森集團王令麟、Magnificent Agents Limited、犇亞證券投資顧問股份有限公司等諸多買家，對華夏股權有興趣，且事後才提報國民黨中常會核備，並由中投公司、光華公司董事會追認，張哲琛更認為是余建新壓英九。
馬英九除了涉嫌賤賣三中外，北檢還查出國民黨舊中央黨部大樓案交易也有問題。檢方調查，目前位在台北市中山南路11號的張榮發基金會大樓，原為國民黨中央黨部，馬英九上任黨主席後，竟未依國民黨財物出售規範辦理公開標售。
馬英九在2005年底，透過長榮集團方姓顧問引薦，親訪該集團創辦人張榮發，雙方達成以總價43億元低價包裹出售該大樓與中影名下華夏大樓（原名中央日報大樓）。
張哲琛作證時，緊咬是馬英九拍板確定只賣舊黨部大樓，連以23億元賣出也是馬英九決定。
