眷宅社也因為規劃眷村土地，以及發包施工、營建管理等工程一條龍業務，讓眷宅社從資本額200萬的小合作社，搖身一變累積了十多億的資產，隨著1996年「眷改條例」實施後，國防部全權接手眷村改建後，眷宅社轉型多元化投資，投資房地產及幫助企業融資，以營利嘉惠目前社員數將近2萬的現役軍人及軍眷子弟。
據了解，眷宅社成員多半為職業軍人和軍眷子弟，由於主管機關為內政部，但業管單位卻是國防部，相當特殊的模式，裡頭理事和監事，多半由職業軍人和退伍高階軍官擔任，主要是利用多元住宅服務、強化社員服務公益與文化等與國防部合作之平台，讓眷宅社能夠繼續推動業務，原本是很低調的一個單位，如今卻因為有幕後黑手意圖不軌，讓蒙上一層神祕面紗的眷宅社才曝光。
而眷宅社的總經理林耀宗對於外界指控澄清，他說：「這些案子都經過所有程序，並透過風險評估、報價，債權保障。並還有請2位大律師來針對所有的案子，來做一個債權確保訂定契約，也經過銀行的鑑定，應該沒有買空賣空這麼攏統的問題。而且他是總經理身為執行者，理事會決定政策，所有案子執行都要跟理事會報告核准。總經理不是合作社代表人，所以沒有這個權責。」
眷宅社總經理：我沒權責一手遮天
眷宅社總經理林耀宗對於社員的指控回應，這些案子都經過所有程序，並透過風險評估、報價，並請兩位大律師針對所有案子債權確保訂定契約，也經過銀行的鑑定，應該沒有買空賣空這麼攏統的問題。而且他是執行者，由理事會決定政策，所有案子執行都要跟理事會報告核准。總經理不是合作社代表人，沒有權責可一手遮天。
另外社員也指控國防部政戰局長聞振國中將，要求各軍總部大量招募現役官兵加入眷宅社，並統一配票支持特定對象，藉由社員大會企圖將糾舉林耀宗的理監事撤換一事，本刊試圖與局長連繫未果，以電話語音留言詢問，至截稿前仍未得到回應。
