據了解，大義宮現有綠蠵龜5隻、玳瑁2隻和赤蠵龜1隻，都是在1989年動保法實施前所飼養，起初是信徒「好心救龜」，從屠戶手中救下將被宰殺的海龜，大義宮原本將海龜養在戶外，但改建後改飼養在地底「龍宮」中。
台灣動物社會研究會指出，從1997年至今，大義宮內已有10隻海龜死亡，分別是9隻綠蠵龜和1隻玳瑁，但海龜壽命可達百年以上，動社會懷疑是飼養環境導致烏龜壽命縮短。
陳金龍則認為這是自然老化，他表示，廟方從1986年前就飼養烏龜，30年過去，烏龜死亡是正常現象，縣府也定期依野生動物保育法的規定前往檢查，確認水池環境符合法規標準。
陳金龍說，目前已控制大義宮的烏龜數量，廟方不得帶入新的烏龜，1997年廟方就曾購買海龜被發現，負責人因而被移送法辦，海龜也被野放，當大義宮的海龜都老死，廟內也就不會再有海龜。
大義宮則表示，海龜長年來已習慣人工飼養，但海龜逐漸長大，現有空間較為擁擠，目前只適合養4隻，將考慮將其中4隻移到海中箱網，先由專人定時餵養，環境適應後再野放，現有的環境也將再改善。
