過去，蔡英文與蘇貞昌被形容為「互有心結」，蘇接任閣揆，蔡蘇體制能否運作順暢？引起外界關切。對此，蔡英文表示，她與蘇貞昌這十多年來共同經歷許多事，包括民進黨下野到重新執政，「他曾經是我的長官，也曾經是競爭對手」，但很多情況都已有所不同，她認為她與蘇貞昌做事的方法，都會跟著調整，像這次內閣組成的過程，她與蘇貞昌並未針對每一件人事做意見交換，她充分尊重蘇的權責，「但他（蘇）改組這幾天，也打了二、三次電話給我。」
蔡總統舉例說，教育部長最後由前部長潘文忠回鍋，而非先前內定的陳良基，「我原本看到報紙，聽說找他（陳良基）做教育部長，這符合我們思考的邏輯，但隔了一天卻變了，倒是沒想到找過潘回來。」她強調，這些人才都很優秀，但是要怎麼運用，「蘇院長會有一個妥適的安排」，除非情況較特殊，蘇才會向她報告並商量。
蔡總統說，這次內閣改組，她與蘇都有共識，要給中生代更多機會，蘇告訴他林佳龍適合交通部長，「佳龍本來就是一個潛力股，中生代可以被考慮的位子都有很多可能性。」最後就由蘇院長自己找林佳龍拍板人事。
相對於蘇貞昌，蔡英文形容賴清德在人事權方面就更為「客氣」，他（賴）都會問我有什麼想法，我都會告訴他，你是院長，你決定就好，但現在覺得蘇貞昌在職權範圍內就拍板，是更有效率。」
對於立院新會期2月將開議，外傳部分綠營區域立委可能入閣，蔡總統也證實，「這在討論過程中，確實有被提到，但最後院長會如何決定，我不知道。」
