外界質疑徐正文影響登機名單，讓非本國籍的旅客被安排上了第一批專機，且未依規定將有迫切需要的人員放在第一順位，有媒體更報導他安排親人搭乘第一批包機回台。對此，徐正文強調絕無此事，同時呼籲「少一點政治少一點口水，大家快點救自己同胞回家」。
對於登機名單備受爭議，徐正文稱「有一些是當地台辦的名單放進去的，這部分我們也不清楚」，放進去的名單當然會有老弱婦孺。至於首批返台名單的依據是三方溝通的結果，徐正文稱最早後援會有503人，昨日又多60多人，而台辦最早公布430多人，與台商協會數字也有差距。
徐正文強調，能搭上專機返台的民眾有8至9成應該都是持有台灣護照，而有些則是陸配，不過她們已在申請台灣籍，且她們的小孩是台灣籍，不可能不讓她們回來。徐正文最後也重申，這個社會需要一點愛，而不是恨，而不是政治。
