2015年，當時的民進黨市議員高嘉瑜指控內湖區有山老鼠橫行，時任內湖分局長的張夢麟否認，還說被查到的木材是漂流木；柯文哲知悉後，怒斥張說謊、要求撤換分局長，沒想到10小時後，發覺全案竟是烏龍一場，緊急要求北市警局暫緩撤換，後來柯也承認，當天張是「掃到颱風尾」，還對張公開致歉。
但柯文哲也並非第一位對警界人士有意見的地方首長，1989年時，現任立法院長游錫堃即將接任宜蘭縣長前夕，時任台北市刑警大隊大隊長的謝銀黨，被省政府調任為宜蘭縣警察局長，由於包括游及將卸任的縣長陳定南，事前皆未獲省政府的口頭或書面告知，2人極為不滿，游上任後，謝多次求見遭拒，縣府更發文要求撤銷人事案，歷經3個多月，謝才「正式上任」。
前總統陳水扁當選台北市長隔年的1994年，警政署調整北市警官人事，遭陳批評是黑箱作業，認為警政署事前未先通知，也未諮詢他的意見，因此拒絕背書，之後陳才與警政署長盧毓鈞達成協議。媒體事後追問相關人事案，盧只寫下「相忍為國」4字回應。
2006年時，警政署當時發布將由彰化縣警察局長林國棟接任台北縣警察局長，讓時任台北縣長的周錫瑋跳腳，痛批警政署此舉踐踏地方自治，認為當時警政署長的侯友宜，在給他的局長候選名單中只提1人太過鴨霸，拒絕承認該人事異動案，甚至不讓林參加治安會報，2個月後才讓林真除。
