武漢肺炎（亦稱新冠肺炎，COVID-19）疫情雖已在中國趨緩，但近日武漢、黑龍江省和吉林省又再度爆發群聚感染。鍾南山表示，多數中國人民仍缺乏病毒抗體，容易染疫，「我們仍面臨巨大的挑戰，我認為目前情況不比外國好。」
鍾南山也證實，武漢地方政府在去年疫情爆發時，封鎖有關消息。當他赴當地調查時，很多人都告訴他疫情其實很嚴重，鍾南山坦承「當地政府不願意說實話」。
鍾南山回顧當時武漢的報告，確診人數連續10天以上都停留在41例，「我不相信結果，所以一直要求他們必須給我真實的數字，我想他們非常不願回答我。」
今年1月20日，鍾南山在中央電視台確認新冠病毒是會傳染的，並告知武漢累計198起確診，包含3人喪命、13名醫護染疫。同天他在一次中共政府官員會議上提議，封鎖武漢防止疫情擴散，當時國務院總理李克強也在場。
鍾南山也對美國疫情爆發感到訝異，認為情況會如此嚴重，是因為大部分西方國家在初期不夠重視。
而關於美國有人說病毒來自武漢實驗室，鍾南山表示，人為洩漏的說法太荒謬，稱武漢沒有能力製作人造病毒。
