在攝影器材上，韓允中依照不同的場景、需要，調整配備。其中拍攝原畫與還原鄭問繪畫技法時，特別使用好萊塢電影等級的RED攝影機，出機時至少有4個助理，以最高規格呈現作品的細膩肌理。至於其他使用不同攝影機拍攝到的畫面，為避免落差太大，也會在事前先行試拍，再到大銀幕上觀察測試剪在一起的感覺。
王婉柔之前拍攝紀錄片《無岸之河》《擬音》時傳主均在世，但執導《千年一問》時，鄭問已過世，她也將此視為新挑戰。「因為鄭問不在了，眾人談論他的話與我們呈現的他，哪個是真的？電影本來就是虛構的，所以會有虛實之間的辯證，當我在想這個問題的時候，就冒出『鄭問看我們拍片』的另一種視角。如果鄭問先生在世的話，他會是什麼樣子？他會怎麼看我們拍他？」因此該片除遍訪鄭問親友、工作夥伴，還以2D動畫重現鄭問身影，穿梭全片。
在訪問部分，王婉柔指出，「以前拍紀錄片時，因傳主在，常會因傳主在做什麼事情、意料之外的，所以可能得犧牲技術，先行搶拍。可是這次傳主已不在，我們少了時間壓力，所以每一場，我和攝影師比較能好好溝通再拍攝。韓允中也補充，這次訪問在光線、背景上，或整個呈現方式都更講究，把場景氛圍營造出來。
