藍營民代多次質疑陳菊身上有許多弊案，若擔任監察院長恐怕將會是球員兼裁判，無法秉持公正客觀的立場進行調查，因此堅決反對陳菊接掌監察院，為此還攻占立法院主席台癱瘓議事，揚言杯葛同意權案。
然而在日前的政論節目中，國民黨團總召林為洲卻認同民進黨立委蔡易餘的說法，表示「陳菊在監察院裡面並沒有任何一件案子」一說完全正確，但林為洲強調，陳菊擔任首長時的機關單位「她的下屬、她的部屬、一級主管，卻有很多案件在監察院，我們在質疑的就是這一點。」
林為洲指出，陳菊的高雄市長任內，其環保署、工務處和一級主管還有很多案子在調查，而且私菸案也是在她當總統府祕書長的期間爆出，可能將來也會有案子。林為洲重申，「我們從來沒有講說『陳菊本身有案子在監察院』，這個要講清楚。」
林為洲質疑，陳菊從機關首長轉任監察院長，面對過去機關的案子要不要迴避、要如何處理？如果調查到最後說案件不成立，人民會不會相信？他直言這些都是陳菊要當監察院長會面臨到最大的考驗。
