回憶2003年和平醫院封院事件，李秉穎說，「SARS當時指揮中心只找了2個資深兒科醫師進入專家小組，但其實兒科醫師最懂病毒，卻被排除在外，那時候如果我有進去的話，作法可能會不太一樣。」
李秉穎表示，其實當時如果覺得無法停止院內傳播，就停止醫療作業，所有病人轉走，所有人居家隔離14天就好了。現在這次院內感染，就是為侷限在少數病房，與其他病房沒有什麼接觸關係，「你把他全部關掉，對於防疫有幫助嗎？」
李秉穎提及，當時很多人是因為封院在院內感染的，光是把人關在裡面，只會造成互相傳染和心理恐慌，「當年我有一個學生在裡面，和他通電話時感覺他有點精神崩潰了，非常非常的畏懼」。李秉穎還說，那時候甚至有公車改路線，繞過和平醫院，這都是無知的過度恐慌。
李秉穎透露，院內感染到處都可能發生，就算不是武漢肺炎病毒，其他醫院每年都在發生其他細菌、病毒（例如諾羅病毒、呼吸道病毒等）的院內感染，不可能0發生率。醫院能做的是透過高規格措施將疫情傳播風險壓到最低，但不可能100％防治院內感染，所以不能說誰做錯、誰就要被槍斃，醫護不幸感染也不代表他們就是不守規定。
李秉穎強調，「醫護是高風險職業，他們明知危險仍去照顧病患，2003年SARS風暴，很多醫護為了工作跟家人分居。」他直言，若發生院內感染要注意的是檢討系統性的問題，以避免類似的事情發生，他也強調不要把院內感染妖魔化。
