台灣武漢肺炎自費篩檢費用近新台幣7,000元，有台商反映，中國湖北醫院採檢費用換算新台幣才344元，不懂為什麼台灣自費篩檢費用如此昂貴，高出中國逾19倍之多，盼指揮中心能調降費用。
對此，陳時中直言「因為我們比較準」，目前不打算調降費用，也還沒討論到自費採檢費用，要等這波疫情穩定再說，而據他了解，中國有些檢驗中心會沒有檢驗就直接批示結果為陰性，一直拿台灣和中國篩檢費用比較沒有意義。
指揮中心發言人莊人祥先前被問到此問題時指出，台灣的篩檢流程比較仔細，核酸檢驗本身試劑就是一筆錢，加上醫院、人力成本等等，如果認為檢驗不值這個價，那也無話可說；針對高危險群或符合通報案件的個案以公費支出，出於個人原因則是自費。
