為了找到關鍵證物，專案小組連續2天派潛水夫下海打撈，當時海床淤積嚴重，撈起槍枝的機率微乎其微，但說也奇怪，一艘準備出港作業的漁船剛發動引擎，船槳產生強大水流，竟意外讓槍枝現形。「忽然就出現在潛水夫手中！」蕭瑞豪回憶這段往事，直呼實在很玄，比對後確認就是凶槍。
至於案發後潛逃中國的戴志明，同年底遭公安逮捕，並遣送到馬祖交給我方，再由警方押解回台受審。隨著楊國傳、戴志明落網，命案終於真相大白。原來，曾是調查局海調處線民的楊，同年3月搭上涉及多起刑案、遭通緝潛逃中國的林姓毒梟，林自稱有上百公斤、市價25億元的海洛因，想從北韓運回台灣販售。
楊國傳找了另一名潛逃大陸的通緝犯莊良賢共同策劃，透過人脈找上福生三號的船長、船員協助運毒，但楊、莊後來想黑吃黑、獨吞毒品，於是又找了戴志明、余國明載運中國籍殺手，槍殺福生三號船長、船員，企圖製造火燒船的意外假象，狠撈一筆。
此案牽連近20人，楊國傳、戴志明雖設下多處斷點阻撓追緝，但法網恢恢，最終還是因諸多無法解釋的靈異巧合，栽在檢警手中。這起喧騰一時的海上喋血案，主謀楊國傳、共犯戴志明分別遭判無期徒刑、15年定讞，莊良賢則在中國人間蒸發，成了漏網之魚。
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