吳怡農今日受邀到廣播節目《周玉蔻嗆新聞》談及藻礁議題，他首先表示，過去環境生態只有少數環保團體在倡議，現在有更多平時比較少關心環保議題的人參與，有這麼多人出來連署公投是好的發展，認為過去雖然也有對話，但不是每個公民都能參與，這是個談台灣能源政策的好機會。
主持人周玉蔻問道，現在有萊豬及藻礁公投，若雙雙過關民進黨是否就糟了？吳怡農說，社會對政黨的信任是來自各個重要議題的立場，而非與誰結盟、上誰的論壇，重要的是在關鍵議題上的立場是什麼、聽到不同意見有沒有辦法及時反應，做更好的討論、溝通和對話。
吳怡農表示，看到藻礁議題過去幾天的發展，從雙方原先要對話又因擔心遭質疑「被政府摸頭」取消延期，可以發現這是信任上的問題，很明顯政府需要重建信任基礎，畢竟推動公投目的就是改變政策，倡議團體有機會跟政府官員對話是好事，如今卻會被指控為摸頭，是不好的現象。
吳怡農也提到，因為藻礁讓大家重新關心能源政策，大家都同意藻礁需要被保護，也同意經濟發展需要有穩定的供電，現在是時候做全面討論。至於贊不贊成民進黨反制公投？吳怡農表示，不管是提出另外的公投案，或者用別的方式，現在必須談的是全面的能源政策。
