曾以紀錄片《養生主：臺灣流浪狗》拿下金馬最佳紀錄片的朱賢哲，在美國研究所攻讀電影製作，該校訓練重視實驗劇情片，他也對實驗電影很感興趣，加上七等生小說具實驗性，「所以想做不一樣的東西，每個導演都應該盡可能走向未知。」
片中有兩段重要的合成動畫畫面，其中之一是以蚯蚓暗喻七等生描述的雜交場面。起初團隊用3D合成動畫，但感覺很假，後來改先用綠色粘土，在桌面製作山丘模型，再放上真的蚯蚓，試拍後發現效果很好。
另一個重現《我愛黑眼珠》裡洪流淹過村落的場面，動畫團隊修改了三、四次，好不容易過關、交片。但求好心切的朱賢哲卻和製片提議更換動畫團隊，由《白蟻：慾望謎網》的動畫師重做，又多花一個月。此舉沒超出實際的現金預算570萬元，是因為夫妻倆打定主意不計所得，「把這部片當成自己的作品做。」
除了動畫之外，找景也不易。他說：「場景若沒有荒涼、荒謬感，就拍不出七等生小說的感覺。很幸運找到兩、三個海景，也找了七、八個碉堡，東北角有些人煙罕至的碉堡我都去過。」
由於沒經費聘請其他工作人員，夫妻倆都是親自勘景，開拍一年前開始尋找。後來片中出現的碉堡，朱賢哲用動畫處理，遮掉後面的餐廳，使沙灘上只有碉堡。
紀錄片《削瘦的靈魂》將於3/19日上映。
