北檢今日因認為彭文正留學經歷豐富，深知論文取得流程，雖然蔡英文的母校確實將其論文佚失，元首之學歷真實性也可受公評，但彭在不向校方詢問的前提下，因查證不足或故意之嫌散布蔡英文假論文的謠言，企圖詆毀當時正在競選連任的蔡英文，因此今以「加重誹謗罪」、違反《公職人員選舉罷免法》意圖使人不當選罪起訴彭文正。
對此，據《蘋果日報》報導，彭文正今也回應表示，他剛從國外返台還在自主健康管理中，不知道自己被起訴一事，不過北檢既沒有開過調查庭，也沒有保全證據，要如何證明他的言論為假？更稱北檢的檢察官自己都被移送司法評鑑，現在還要起訴他根本是「笑話一則」。
而彭文正下午也拍影片表示，起訴對他來說反而要「謝主隆恩」，因為案子若繼續留在北檢就會因偵查不公開黑箱作業，若不起訴他前面辛苦的布局也就化為烏有。反倒是自己一旦被起訴，案子就可以進到地方法院，甚至到二審、三審，過程可能要4、5年；屆時蔡英文已下台，也可以屏除司法干預，在公開審判之下，就可以讓更多人了解這件事的是非黑白，直呼「當然是一件好事」。
