據了解，當時一輛台鐵北迴線明隧道施工廠商的工程車，違規停在大清水隧道上方20公尺的施工便道斜坡上，疑似因為未拉手剎車，導致工程車從高處滑到到鐵軌上，直接撞擊害太魯閣號車頭和駕駛室，導致列車撞上山壁，整節車廂幾乎被撞成廢鐵。
由於台鐵北迴線正在51K處施作明隧道工程，目前正值清明連假疏運期間，工地都必須停工檢查，據了解，隧道上方其實有平坦處可停車，但工程車駕駛可能因為便宜行事，竟直接將車輛停放在施工便道上。
該施工便道的坡度約為20至30度，加上車輛沒有確實拉好手煞車，才會釀成嚴重死傷；釀禍廠商在發生事故後已趕抵現場，詳細事故原因，相關單位仍在釐清中。
