潘忠政27日在廣播中透露，自己和其他環團代表22日與總統見面，當時他告知總統目前中油第三座天然氣接收站的開發仍會破壞約莫200到300公頃的藻礁生態，卻得到蔡英文「工業區開發現面積已後退1公里」的回應，讓他感嘆蔡英文仍是局外人。此外，潘忠政還稱，自己當時有約蔡英文29日去看藻礁，不過一直沒有收到總統府通知。
對此，今農委會主委陳吉仲赴立法院經濟委員會進行報告前受訪表示，當時的實況是潘忠政邀請蔡英文去看藻礁後，蔡英文回應會找時間到現場觀看，只是時間上可能無法配合，推測應該是蔡英文與潘忠政間的訊息接收有落差。
陳吉仲也指稱，蔡英文對於藻礁相當關心，現階段就是積極與環團和學術界討論如何解決問題、降低對於藻礁的傷害，經過幾個月的密集溝通，有把握找到雙贏的方案。陳吉仲更強調，能源轉型是相當重要的事情，大家如果對於「非核家園」有共識，那麼減煤、保護藻礁絕對有信心達成。
