據《蘋果日報》報導，近日有馬偕醫院的醫師出面爆料，指馬偕醫院院內的醫療裝備相當短缺，像是N95口罩的部分一人只發2個，還規定要戴滿8小時否則就要重複再用，且相關防疫類裝備只供專責醫護使用，包括門口防護員、停車場警衛都沒有嚴謹裝備，恐成防疫破口。醫師更稱，已向上級反映裝備問題，但裝備就是發不下來。
除此之外，該名醫師還透露，目前馬偕的急診室已經滿床但仍對外開放，由於上面病房還沒清出來，許多篩檢陽性的病人就排排躺在急診室內的一塊區域，其他不知情的病人仍繼續看診，雖然上週有進行急診室清消，但時間相當短，醫護人員壓力都很大，包括內科及小兒科皆因有確診病患出現已陸續關閉病房，然後院方又要將原本的病患移到其他病房，憂心已有病毒在院內蔓延。
另一方面，雖然日前中央和地方政府都表示醫院在整修負壓隔離病房，不過其實只是加裝電扇排風，並無完整負壓，甚至院方還指稱「大家都這樣做」。對於這些現象，爆料醫師也透露許多醫護至今都不敢回家，每天活在恐懼之中，建議馬偕應該要半封院、做完全面普篩後再重新開放，不然可能會發生院內感染導致封院的情況。
對此，馬偕醫院方則回應稱，目前院內的N95口罩因為取得管道為政府配發與向國內合格廠商訂購，疫情升溫後暫時供不應求，才會針對院內口罩做控管，但供急診、防疫病房和負壓隔離病房的醫護使用是沒有問題的。
除此之外，目前院內因應政策改裝樓層作為專責病房，「並無院內感染問題」。而抽風設備為保護員工才裝設的，由於加裝風扇可讓病房成為「微負壓」狀態，病毒才不會在走道、護理站等區域擴散。
