吳正南脫序大鬧海軍，連該班移師空軍技術學校訓練2週時，他也無視周日晚上9點40分集合收假規定，連續2週藉故家中有事請假，直到週一早上才收假，且因坐夜車關係，到了學校又因精神不濟整天睡覺，種種行為讓軍方看不下去，多次向艦隊分署反映。
艦隊分署認為茲事體大，指派專員、督察對相關人等訪談調查，沒想到吳男竟大言不慚地表示，自己因膝蓋有傷不能大步走路，才會每次集合都遲到，受訓期間曾與一名海軍上士討論潮吹話題，至於被投訴上課看色情片，吳男說當時手機突收到一封LINE訊息，打開一看才知是色情片，由於當時手機不是靜音狀態，才不小心播出聲音。
儘管吳正南言之鑿鑿，但艦隊分屬認為他代表北部機動隊參加訓練，卻屢次上課遲到早退、在課堂趴睡，也不願配合施訓單位生活規範，還在上課時看色情人片，與人大談潮吹話題，加上對女性學員的輕挑言語，種種行為對海巡聲譽造成嚴重負面影響，因此將他記過兩次懲處，並於今年1月5日將他調任南部機動隊派往澎湖第8海巡隊屏東艦服務。
屏東艦於2016年成軍，為1,000噸級巡防救難艦，船速24節，配備40快砲、20機砲及水平射程120米高壓水砲，並有可供5噸級以下直昇機起降的飛行甲板，常駐澎湖海域，負責守護家鄉，避免中國漁船侵門踏戶，責任重大，但吳正南長期請病假，人幾乎不在澎湖，目前只等著8月2日退休。
吳正南不甘被發配外島，2月間向公務人員保障暨培訓委員會提起複審，主張艦隊分署沒按規定先舉行性別工作平等會調查，就擅自將他記過兩次，程序違誤，請求撤銷原懲處，但保訓會認為，吳正南是因言行失檢嚴重損害機關形象受懲處，與性別平等事件無關，因此駁回他請求。
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