Omicron變種病毒入侵台灣造成大規模感染，雖然高達99.77%都是輕症或無症狀者，但不能接種疫苗的5歲幼兒及疫苗接種率不高6至11歲兒童，在這波疫情中陸續傳出重症及死亡個案。對此，指揮中心也多次在記者會上提醒家長，兒童腦炎重症前驅8大症狀，記得要盡速就醫評估，包含體溫高於41度、意識不佳、持續昏睡、持續頭痛、持續嘔吐、肌躍型抽搐、抽搐和步態不穩等。
為了讓更多孩子們能擁有一定保護力，疾管署目前已開放5至11歲兒童可以接種COVID-19疫苗，滿5歲至11歲兒童可接種0.2 ml劑量的輝瑞BNT，滿6歲至11歲兒童則可接種每劑0.25 ml劑量的莫德納，並建議接種2劑時間應間隔至少4週（28天），衡量接種間隔拉長可能有助於疫苗免疫力提升與可能降低罕見心肌炎/心包膜炎不良事件發生風險。
不過目前兒童輝瑞BNT釋出數量有限，加上有部分家長擔憂莫德納副作用較強，仍處於觀望階段。醫師張博揚昨於臉書po文，呼籲家長們別糾結兒童版BNT，「MODERNA（莫德納）半劑也是可以提供6足歲很好的保護力，在這狂風暴雨的當下，手臂痛又算什麼！不要再糾結了！」
