林智堅在宣布參選桃園市長之際卻爆出論文抄襲案，名嘴更找出台大國發所碩士生余正煌論文，指林智堅論文與余正煌的民調資料一樣，林智堅則強調自己「絕對經得起考驗」。國民黨台北市議員鍾小平、徐巧芯等人則具名檢舉林智堅抄襲，台大受理後則表示，受理檢舉後預計2個月內完成審定。
針對林智堅論文抄襲案，台大今表示，將依據「國立臺灣大學博、碩士學位論文違反學術倫理案件處理要點」成立審定委員會，並依程序展開調查，本案處理均遵循規定程序，並依要點規定進行，在召開審定委員會時，將通知相關人員到場陳述意見或提出書面說明。林智堅將需提出書面說明或是到場陳述意見，必要時也會請指導教授陳明通列席。
