依照《正副總統選罷法》規定，各組候選人的選舉得票數達當選票數1/3以上，補貼競選費用每票30元。當選人民進黨賴清德、蕭美琴拿到558萬票，約可獲得1億6,740萬餘元；落選的國民黨候選人侯友宜、趙少康拿到467萬票，約可拿到1.4億元補助款；民眾黨候選人柯文哲、吳欣盈得票數為369萬票，可獲補助款約1.1億元。
賴清德昨在民進黨中常會上說明1.6億元補助款用途，將分為三等分來規劃，一是按照規定繳回中央黨部，二是捐給中央黨部，由黨部規畫用在兩大用途，包括提供創黨及建黨黨員的生活照顧，以及提供年輕的黨工出國或在國內進修的獎勵金、獎學金；第三部分則會捐作公益使用。
侯友宜今上午在五股區視察二重疏洪道工程，在媒體聯訪時被問到補助款的運用，侯友宜表示，補助款都回捐給國民黨中央黨部，由黨部統籌規劃，而他也會建議黨中央可以妥善規劃，多照顧弱勢，以及讓年輕人多關心公共事務，推動各項能讓國家往前走的方向。
至於柯文哲部分，民眾黨發言人李頂立昨表示，補助款將用在政黨營運，包含黨團和地方經營，柯也在計畫全台灣走訪蒐集民意，部分將用做公益使用。
