行政院指出，此次協定確立台美對等關稅15%，且不疊加，並兼顧糧食安全、軍工韌性與民眾健康。協定談判達成六大目標，包括提升產業國際競爭力、守護民生健康、優化經貿環境、強化經濟安全、促進雙向投資，以及確立高科技戰略夥伴關係。
在農產品部分，台灣成功確保27項主要農產品關稅維持現行水準，其中包括稻米及米製品、雞肉、牡蠣、蛤蜊、大蒜與乾紅豆，並維持原有稅率及關稅配額（TRQ）。此外，台灣爭取到共計2072項輸美產品可豁免對等關稅，包括蝴蝶蘭、茶葉、芒果及觀賞蛙等，占台灣輸美產品對等關稅總項數的20%，出口價值預計2024年約99億美元。
針對美豬進口關稅，協定規定自第3年起降至一半，即6.3%至10%。其他31項農產品關稅亦將調整至特定稅率，包括鴨肉、鵝肉、鮮葡萄、橙及寬皮柑等。行政院表示，後續將把《台美對等貿易協定》與1月簽署的台美投資MOU一併送請立法院審議，盼國會支持通過。