根據金管會調查，台新證券在短短兩週內災情頻傳，第一波發生在4月7日，因資料庫效能不足，導致系統龜速；4月14日，程式異常引發回報停頓，造成20億元巨額錯帳與申報延遲；4月20日，「PhoneEZ」APP因主機記憶體不足，介面出現「轉圈圈」無法下單。
金管會證期局副局長黃仲豪表示，針對4月14日的錯帳延遲申報，證交所已可先行開罰10萬元違約金。然而，這僅是前菜。金管會強調，待證交所完成實地查核後，將依《證交法》針對「內控缺失」進行重罰，罰鍰區間為30萬至600萬元。此外，金管會手中還有業務限制、人員處置等其他監理工具，絕不只有罰款了事。
針對外界質疑20億錯帳僅罰10萬「不成比例」，證期局解釋，10萬元僅是「延遲申報」的處罰，後續的重頭戲在於系統穩定性與內控。金管會已要求台新證券釐清事故真相，並提交短、中、長期的改善措施，必須確保系統架構足以負荷合併後的交易量，杜絕事故重演。
證期局說明，錯帳後券商需進行「反向沖銷」。例如券商替誤下單的客戶買進110元股票後賣出，若賣在115元反而有獲利，若賣在105元則虧損5元。因此20億元是「成交總額」，而4,300萬元才是處理完後的「實際損失」。
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