為避免輕症疑似個案集中至大醫院急診篩檢，造成急診壅塞、影響急重症醫療量能及引發院內感染，指揮中心自2020年建置COVID-19採檢網絡，指定199家社區採檢院所，提供有採檢需求之社區民眾前往。
指揮官陳時中表示，經中華民國醫師公會全國聯合會及台灣耳鼻喉頭頸外科醫學會提報有意願提供採檢服務，且完成診所採檢點、感染管制及傳染病通報自我查檢整備作業之診所家數，共計437家，其中190家完成合作檢驗機構規劃，已納入指定社區採檢院所，可提供抗原快篩（含家用快篩）陽性民眾，或有相關症狀經醫師評估懷疑染疫等符合公費檢驗者，進行PCR核酸檢驗採檢服務。
190間診所名單已公布於衛福部疾病管制署全球資訊網「COVID-19防疫專區」/台灣社交距離App及採檢地圖/COVID-19全國指定社區採檢院所地圖，以利民眾查詢。請民眾前往上述診所前，先以電話預約聯繫，確認服務時段及預約狀況再前往。其餘有意願且已提出申請之診所，正由聯合會及學會協助媒合檢驗機構，將於完成整備作業後，納入下一波公布名單。
