立法院長投票結果，國民黨團所推的韓國瑜獲54票、民進黨團所推的游錫堃獲得51票，藍綠兩黨團均票票入軌。而有8席立委的民眾黨團，原應8票集體投給黃珊珊，但開票結果，黃珊珊卻僅得7票，另有一票雖然蓋給黃珊珊，但票面上有印泥沾汙。
民進黨團監票員陳亭妃主張應記為廢票，民進黨團立委林楚茵亦公開附和。現場監票員討論後，同意交由會議主席柯建銘裁決，柯建銘依「立法委員互選院長副院長投票及開票辦法」規定，裁決此票為無效票。
「立法委員互選院長副院長投票及開票辦法」第13條第1款規定，開票監察員於開票時，對於廢票之認定應共同決定；有爭議時，由全體監察員表決之。表決結果正反意見同數者，取決於選舉會議主席。第13條第2款規定，廢票認定標準包括「記入其他文字及符號」。
另外，因為立法院正副院長選舉辦法規定，立法院長投票已過半者當選，若無人過半，應進入第二輪投票。因上午投票無人過半，因此下午立院將進行立法院長第二輪投票，由上午得票第一、第二高票的韓國瑜、游錫堃角逐國會龍頭。
