內政部今也發出聲明，指葉俊榮申請的「區域憲政主義：亞洲聚焦」研究案在葉入閣前由科技部核准，為期3年，葉俊榮決定入閣後就已申請由科技部同意延期執行，因此葉目前並沒有正在執行的學術研究計畫。
科技部指出，因吳焜裕、徐永明、陳宜民3人於擔任第9屆立委前，分別擔任台大教授、東吳大學副教授、高雄醫學大學教授，符合相關作業要點規定資格，可由任職機構提出研究計畫申請。至於學者兼有立委身分執行科技部研究計畫的利益迴避，科技部將再研議檢討相關規定。
科技部還指，依「科技部部正副首長及一級單位主管申請專題研究計畫處理原則」規定，科技部長於任職期間不主持專題研究計畫，科技部副首長及一級單位主管任職期間不得同時執行超過1件專題研究計畫，正副首長及一級單位主管到任後仍執行中的專題研究計畫，應於到職日起3個月內，由原任職機構向本部辦理計畫變更。
科技部長陳良基主持的研究計畫，在去年5月至今年2月借調至教育部擔任政務次長期間，均依規定未支領主持費。今年2月8日借調至科技部擔任部長後，依規定應於今年5月8日前完成執行中計畫變更，現在正辦理計畫變更作業。
至於政務委員林萬億、吳政忠、經濟部長李世光及原能會主委謝曉星，科技部指出，4人執行計畫都依規定，未支領研究主持費。
