法務部指出，對於毒品問題，重刑化仍有一定的嚇阻作用，為有效防制毒品氾濫，目前對於製造、販賣、運輸各級毒品的重刑化政策不宜輕言改變，法務部認為，基於毒品零容忍的態度，對製造、運輸、販賣毒品者應再提高法定刑；至於施用毒品者，法務部認為，施用毒品行為主要傷者為自己本身，屬無被害者犯罪或道德犯罪，除罪化將有助於紓解監獄超額收容問題，也可降低因監禁處遇而對毒品施用者生活所造成的負面影響，但應在考量配套措施後再討論。
法務部指出，吸毒除罪化需有8項相關條件配合，包括：1、司法、衛生與醫療人力的完善程度；2、完善的法律制度；3、成癮者的社會復健機制；4、毒品施用本身對社會、家庭及個人等影響程度；5、衛生醫療設施之配合程度；6、國際毒品施用之治療趨勢；7、總體經費配合程度；及8、民眾對除罪化的接受程度。
此外，目前有86.36％民眾認為應以刑罰制裁毒品施用行為，並有75％民眾不同意對製造、運輸、販賣毒品採嚴刑峻罰，而對毒品施用改以治療方式除罪，法務部認為，除罪化可能造成9大不利影響，分別是：1. 缺乏司法強制力，無法監控毒品施用人口；2. 增加毒品查緝上困難；3. 施用者接受治療意願下降，醫療無法有效介入；4. 僅採行政罰，會使戒毒執行效率降低；5. 缺乏監控與強制治療機制，造成家庭經濟負擔、人際衝突等問題；6. 造成毒品施用升級與氾濫；7. 其他犯罪問題；8. 國家生產力下降；9. 健保給付衍生問題等負面影響。
對於明（20日）司改國是會將討論毒品議題，法務部將以上述9大理由，表達反對吸毒者除罪化立場，法務部認為，目前對於施用第一、二級毒品者，並不存在除罪化的條件。
