吳音寧強調，她對於北農經營是朝向公開、透明、公正的方向前進，務實面對問題、解決困難。面對外界不斷批評自己領取高薪，她表示任何人擔任北農總經理薪水都是依循公司制度，而她與韓國瑜時代不同的是獎金發放的制度。
九合一大選民進黨大舉落敗，除了失去執政20年的高雄外，農業大縣雲林與彰化也都綠地轉藍天，吳音寧接任北農總經理所引發的爭議，更讓她被貼上「是韓流的推手、助選員」，任內發生的諸多爭議，更被劍指爭議壞了民進黨形象。對此，吳音寧回應，接任北農總經理前，韓國瑜已離開數月，她才被徵詢接任此位，而接任更是通過柯市府與農委會同意，而外界不斷攻擊她與她的家人，甚至是農委會副主委陳吉仲，都是難以接受的事。
吳音寧強調自己態度不變，會秉持務實態度解決台灣農業問題，她個人去留不重要，交給農委會決定，但她絕不會向謊言低頭，特別是向強勢的謊言低頭。面對農委會主委林聰賢說吳音寧已完成階段性任務，她表示不管誰在北農總經理位置上，所有的改革是持續的，台北市長柯文哲說希望下一屆總經理人選是要專業及出席備詢，吳音寧回應，依法總經理沒有必要到市議會備詢，她也希望北農不要再被標舉在政治角力中。
北農今（29）日下午將舉行董事會討論明年度預算及民股董事遞補，預計吳音寧去留將是這場會議的焦點，但目前北農董事會共23席、北市佔5席、農委會5席、全國農會5席、青果社2席，民股業者則是佔有6席，若要讓吳音寧離開至少要過半同意，才可能成案。
