2019年5月，基隆已婚康姓男公務員與大11歲的失婚婦人小美外遇後分手，去年9月，小美怒告前男友趁她酒醉，把她帶到墓園性侵。檢警調查後認定，案發時2人為男女朋友，且隔了7個月才提告，罪證不足，康男不起訴。
2019年1月，在台北市政府當公務員的女子小愛與張姓人妻的老公開房間，張女抓姦時嗆聲：「要找記者、柯P來！」結果被小愛控告恐嚇，張女不起訴確定。小愛事後怒罵張女：「不要臉！」被法院認定有損張女名譽，判賠3萬元。
2018年7月，新北市徐姓公務員和人妻同事小芬偷情8年，徐男甚至大膽到小芬家接她出遊，遭小芬丈夫起疑，姦情曝光。檢察官依女方指證徐男下體有明顯黑痣並當庭勘驗確認，成為偷情鐵證，徐男被依通姦罪判刑8個月定讞。
公務員偷情案例多，柯市府幕僚的爭議也不少。2016年6月，柯市府針對大巨蛋調查報告洩密案，進行內部測謊，對外宣稱拒絕測謊而離職的黃姓男幕僚，傳出真正離職的原因是洩漏柯文哲不公開行程給某電視台女主播，做為「把妹」工具，才被柯P趕離台北市政府。
2015年9月，柯文哲競選台北市長時的幕僚、前悠遊卡公司董事長戴季全，因推出日本AV女優波多野結衣悠遊卡，引發爭議，戴多次說此專案為「員工提議」，之後在電台專訪時不慎透露自己才是始作俑者，最後黯然下台。
同年9月，前台北市政府市長室邱姓專員在柯文哲競選台北市長時，擔任柯辦的網路議題分析小組成員，並負責人事招募業務。但他進入北市府後沒多久，就爆發替友人「喬」替代役的弊端，最後邱閃電辭職離開市府。
2015年3月，柯文哲競選台北市長期間的隨行秘書范揚杰，遭爆向遠雄拿10萬元「喬」大巨蛋移樹之事，范否認。柯表示：「都知道了，不是我們的人，去年開除了。」遠雄集團則強調，絕不會跟任何人私下協調這種事情。
