武漢肺炎在台灣目前已確診8例，在春節過後的第一個開工日，北市府宣布第一線員工需要戴口罩，特別是在櫃檯工作的員工，因為和不特定人士接觸，無法確定接觸的人是否有感冒、呼吸道症狀，所以特別需要注意。
柯文哲表示，目前中國確診人數已達到6000例，他認為依照知識「很快就會超過6000例以上」，而且台灣與中國的密切程度，將使未來一週成為「防疫危急期」。他認為這期間若出現很多案例，就「麻煩了」，因此為了保護自己還是戴上口罩為佳。柯文哲也表示，還好台灣人戴眼鏡很多，他也勸大家這段時間「不要戴隱形眼鏡」，說「戴眼鏡至少還可以保護眼結膜」。
對於美國約翰霍普金斯大學（Johns Hopkins University）預測「台灣會是這波擴散風險的第二名受害者」說法，柯文哲表示，以交通往返的密集度來說，其實「沒有不對」，但從非洲豬瘟未傳入來看，就能證明以目前台灣的醫療、防疫體系來看，是排名在世界很前面的。
而對於高雄市政府要求「私人企業」第一線櫃檯人員強制戴口罩、量體溫，柯文哲表示，在政治上，北市府是由內而外、由公而私，所以會對公家機關下「行政命令」，對私人機關是「建議」。市府也會觀測疫情變化，下相應命令，不用過度恐慌，但也會做好準備。
