吳怡農表示，政府過去4年不斷地倡導「資安即國安」，但網路攻擊未被有效阻絕，幾乎所有核心政府單位的資訊系統都曾被成功滲透；加上各機關之間都有連線，造成的損害難以估量。
吳怡農說，總統或行政院長若下令檢視2016年至今所有涉及政府系統的資安事件，就會發現一個清楚脈絡：從最高機構總統府到三級單位如氣象局，政府的資訊網絡極為脆弱，並長期遭受境外勢力大規模、系統性侵入，包括全民健保資料庫、公文系統等等，近期更透過委外廠商取得系統權限。
然而，過去發生資安事件，受害單位往往各自尋求委外廠商個別處理，將電腦或伺服器「清理乾淨」，就結案了事；此類事件也大多在國安單位還未參與調查前，就被歸類為「非國安事件」「非涉及核心業務」處理，並未進一步檢視系統性威脅，甚至沒有提出防患於未然的措施。
吳怡農認為，雖然目前外界有種種假設──也許是資訊混淆和政治操作；或許涉及內部人員、或許是境外干預；無論如何，在調查尚未明朗前，我們不在此時作任何揣測。如果確實涉及總統府電腦或系統的侵駭，將會是對中央政府機關最深切的警惕。
