台灣自3月22日開放醫護施打疫苗，不過由於國外頻傳施打AZ疫苗過後出現血栓的事件，因此許多人都對接種疫苗望之卻步。對此，莊人祥今指出，AZ疫苗在其他國家其實反而效果比較好，歐洲的幾個國家雖然出現血栓相關事件，不過歐洲藥管局仍認為AZ的安全性沒有特殊問題；由於BNT和Moderna疫苗是在美研發，國外許多人基於愛用國貨才會選擇這兩者，但AZ疫苗4月也有望在美上市，只是台灣醫護要不要施打還是可以自由選擇。
此外，日前上海復興藥廠稱可以提供台灣「復必泰疫苗」，是否台灣會接受？對此莊人祥則稱，目前法規只要是中國製的疫苗就不合法，復必泰是深圳製還是德國製這部分會再研究，但台灣這邊有直接跟德國BNT聯繫，已把合約寄過去，目前尚未有回應，不過德國也沒有要求台灣透過上海復興與其洽談。
至於日前傳出台灣購買3,000萬的BNT疫苗，卻買貴14美元（約新台幣400元），甚至還傳說有機密會議，對此莊人祥則澄清，台灣從未向BNT採購過3,000萬的疫苗，而報導說自己參加過4次會議，但事實上整個團隊都未見過所謂合約，自己更從未參與過報導所稱的任何會議。
