「2021台北購起來」提供民眾選擇是否要使用「串聯雲端發票綁定機制」，若勾選則需提供雲端載具之條碼及密碼，填寫成功即可自動串聯至財政部平台，後續不需登錄就會自動把符合資格的雲端發票匯入。
根據《蘋果新聞網》報導，有軟體工程師向其投訴稱，「2021台北購起來」是由商業處外包給「地平線文化事業股份有限公司」執行，擔心這樣民眾的消費紀錄會被不當使用；而在會員註冊頁面最後的隱私權條款中，可見其表示會蒐集姓名、電話、E-MAIL、IP等個人資料，不過僅作總量分析使用，並且不會提供給第三人。
然而投訴人在看過隱私權條款後仍質疑，該些條款僅針對「蒐集資料的方式」做說明，但對於「手機條碼、消費資訊的用途、使用期限及活動結束後是否會持續存取使用者的帳號等」均未明確敘述，質疑恐怕有違反《個人資料保護法》第8條，公務機關或非公務機關向當事人蒐集個人資料時，應明確告知當事人如蒐集之目的、個人資料利用之期間、地區、對象及方式。
台大法律系畢業的議員苗博雅也認為，商業處在民眾知情同意之下應告知資料蒐集的範圍與時間，民眾若想退出活動，資料也應確保完全刪除。不過實務上若真的發生個資洩露問題，民眾恐難以在法律上求償，並指北市府為了讓振興活動倉促上路，細節上沒有體諒到民眾。
對此，商業處的副處長江美玲回應稱，「2021台北購起來」和財政部合作的平台僅能看到200元以上的發票，且活動結束後廠商就無法收到發票，合作廠商也不得隨意使用相關資料，不然會有違法疑慮。而負責此平台的外包廠商「地平線文化事業股份有限公司」目前則未有回應。
