但本刊調查，林志民於1993年離開中科院轉往元智大學任教後，在1999、2000年就主持中科院的「綜合電子戰技術之學術研究」，研究經費約154萬元，主要研究項目有：1.低截獲率雷達信號偵蒐及辨識技術研究；2.被動同調電子偵蒐系統研究；3.虛擬影像地理特徵與編碼邏輯分析研究；4.被動偵蒐系統之短基線時差定位方法研究及其應用。國科會、中科院宣稱後該計畫各項技術開發將有助於提昇電子戰能力，以應付敵方各項先進武器威脅，增強國防戰力。
此外，林志民在2016年前往廈門大學擔任學者時，更公然主持「中國自然科學基金執行計劃」，該計畫名稱為「模糊大腦情感學習神經網路及控制、分類及自適應濾波各類系統應用」，該成果獲得中國補助，也必須向中國報告，此狀況中科院想必也渾然不知，卻直接認為與洩密無關，還在第一時間撇清、切割，令人感到荒謬！
更諷刺的是，據媒體報導，中科院內部洩密件數已達百餘件，根據國防部向立法院提出的「國防廠商安全調查暨保密稽核執行成效報告」指出，因應中共多層次、多面向的滲透、竊密手段，生產研發軍備的中科院人員自今年起採全院境管，且配合國安局專案工作，針對涉密離退離職人員，必須依《國家機密保護法》限制出境。可見國防部自知問題嚴重，才會開始對相關人員進行嚴格規範。
