《粽邪3：鬼門開》雖然費心打磨劇本，又有金馬獎技術團隊操刀，但去年4月開拍前夕，新冠肺炎疫情爆發，打亂所有行程，甚至一度停拍。鄒介中不諱言：「疫情是超級大考驗。當時原在新北市借到的舊大樓主景，因人心惶惶，居民擔心疫情不願出借，加上確診數一直飆高，只能忍痛喊停。」
半年多後，影片復拍，但重新啟動面臨更多狀況：檔期無法配合的演員、工作人員，必須更換；場景得重找並陳設佈置。鄒介中忐忑不安，還是帶領團隊撐下去。「只能往前進，因為沒有退路。」開拍後又遇上主要演員確診，連帶影響班表，臨時改下台中拍攝戶外戲。「我們的班表幾乎每天變、隨時改，幾乎像在拍on檔的電視劇，幸好有台中真武宮、朝元宮等配合，還有影視發展基金會的協調，才能應變。」
除了疫情攪局延宕拍攝，壓軸的正邪大鬥法戲又因風雨吹壞場地，改在廢棄戲院內，以綠幕搭配特效呈現。但如此一來，特效鏡頭超過200個，幾乎相當於前兩集的總和，而且首次開拍的前製作業已燒掉將近1,000萬元，花費因此大幅提高。不過鄒介中強調，很多觀眾都反映大鬥法的戲要長一點才過癮，我們也想長一點，儘管想過癮就要花預算，還是努力做。
