由於潛艦國造曾被人說是「鐵棺材」，因此包括海軍前司令黃曙光與台船前董事長鄭文龍都對外宣示，會隨同海鯤號進行潛航測試；但在這兩人離職後，隨後接任的海軍司令唐華、蔣正國與台船董事長黃正弘、陳政宏都表達「潛艦測試不會上船」，更讓潛艦國造的安全性遭質疑。
爆料人士向《鏡報》指出，海鯤號潛艦在泊港測試時即發生液壓系統出現問題，負責的外國廠商搞了40個月都搞不定，但是海軍司令部為趕在520前夕執行「政治性出海」的海上測試，一再催促台船要提前執行海測，台船最後被逼，在柴電主機未完成併聯的情況下，第一次出海完全以電瓶電力，所以僅2個小時即返航；第二次出海即發生X型尾舵的液壓失效，艦上官兵用手動的方式才保住海鯤號潛艦。