檢察總長顏大和在今天，特地帶媒體參訪特偵查組時說，對於特偵組走入歷史，感到依依不捨，因為他花了很多精神在特偵組，但法律規定特偵組 結束，他身為執法者，就要依照法律規定辦理，在說明特偵組將結束時，顏大和也一再強調，今天不是記者會，因為沒有那麼光榮。
特偵組是在前總統陳水扁任內，在2007年4月2日成立，當時成立的理由是為查緝國家元首、高階中央政府官員與軍事將領的貪瀆行為及國家重大經濟犯罪案件。
特偵組前身是高檢署「查緝黑金行動中心」，後來改制成立特偵組後，辦公室先設在台北市館前路的三井物產株式會社舊廈，到了2009年10月才遷到信義路的國防部文化營區；今年9月21日，立法院司法及法制委員會初審通過「法院組織法刪除第63條之1」，特偵組在2017年1月1日正式廢除。
查黑中心曾偵辦過景文案、前立委羅福助案、立委顏清標案、陳水扁國務機要費案、前台北市長馬英九特別費案。
到了特偵組時期，從全國各地挑選了一批菁英檢察官，偵辦過林益世中收賄案、國安密帳案、拉法葉艦採購弊案、特別費案、中藥商公會全國聯合會行賄立法委員、國務機要費案、扁家洗錢案、龍潭購地弊案、南港展覽館案、陳敏薰買官案、辜仲諒政治獻金案、機密外交案、二次金改案、辜仲諒違反證券交易法案、司法官貪瀆正己專案、羅福助炒股案、中信金弊案等矚目案件。
特偵組也曾簽結或不起訴不少大案，包括：民進黨四大天王特別費案、立法院長王金平特別費案、台郵挹注陽信百億元案、國民黨黨產三中案、國發院土地交易案、富邦魚翅宴案、前總統府侍衛長余連發背信案、機場捷運工程弊案、華揚史威靈案及宇昌案。
由於綠營立委質疑特偵組介入政爭，頻頻疾呼廢除特偵組，法務部還曾用書面以五大理由認為應該廢除特偵組，理由包括：
- 一、特偵組影響檢察機關內部監督機制。
- 二、違反行政法上機關與職務不兩立原則。
- 三、概括條款明訂特偵組事務管轄、違反法律明確性原則。
- 四、檢察官具有司法屬性，沒有再設置特偵組的必要。
- 五、違反再議程序及案件管考制度。
法務部也建議，立法院可修「法院組織法」，讓疊床架屋的特偵組退場，使檢察體系回歸正常，也主張檢察官辦案不分大小案，無須另設特偵組。特偵組目前已將手上大案交由各地檢署偵辦，例如扁案時所通緝的前新光醫院副院長黃芳彥，也由北檢接手偵辦。
