追思會由蔡英文先頒發褒揚令，隨即進入覆蓋國旗儀式，由副總統陳建仁擔任主祭官，外交部長李大維、國防部長馮世寬、內政部長葉俊榮、監察委員劉德勳擔任覆旗官。接著播放片長約12分鐘、以「台灣寧靜改革的工程師」為題的李元簇追思影片，影片播放時，李元簇的二媳婦忍不住難過情緒，痛哭流淚。
緊接著，由李登輝代表追思致辭。他回憶，2012年10月去探望李元簇時，李曾大聲地對他說：「總統，我們都做到了，沒讓大家失望。」他也表示，對李辭世雖有千萬不捨，但「終歸都是主的安排」。
李登輝還說，外界雖常以「沒有聲音的副總統」形容李元簇，但李總能堅守立場、不計毀譽、不畏權勢，面紅耳赤地大聲爭論到底，讓既得利益者知難而退，所以尊稱李是「最佳的幕僚典範」，當之無愧。追思會接著由李元簇家屬代表致謝辭後，進入公奠程序，場面備極哀戚。
歷任正副元首幾乎全員到齊，僅保外就醫中，雖申請出席但未獲台中監獄核准的前總統陳水扁無法出席。因傳出是總統府邀請而提出申請。總統府今表示，總統府協助處理治喪事宜尊重家屬依李元簇遺願，不發訃聞而以訃告方式處理，總統府並不會個別邀請各界人士出席，但對歷任正副元首因有安全規劃上準備，所以會詢問是否出席以利安排，「沒有邀請出席告別式這樣的問題」。
今天追思會現場包括前副總統吳敦義、蕭萬長、行政院長林全、立法院長蘇嘉全、考試院長伍錦霖、監察院長張博雅、司法院長許宗力、親民黨主席宋楚瑜、國民黨主席洪秀柱、時代力量黨主席黃國昌、前立法院長王金平、前國民黨主席吳伯雄、前考試院長許水德、前監察院長錢復等人士都到場致哀。
