嘉義縣長張花冠日前指控立委陳明文在出席活動時搭她的肩膀，令她感到不舒服，對陳明文提告性騷擾，張花冠事後在臉書指陳明文官司都處理好了，質疑陳明文干涉司法，陳明文對此表示感到非常遺憾，強調絕無性騷擾與介入司法，並辭去民進黨選對會召集人一職。
立委陳明文2008年被控2007年辦理民雄汙水下水道工程標案時，將底標6億5400萬元洩漏給當時的偉盟工業公董事長賴文正，偉盟公司2天後以6億5380萬元得標，因賴文正有不利陳明文的證詞，陳明文因此遭收押後，遭依貪汙、圖利及洩密等罪起訴。
一審嘉義地院審理時，賴文正翻供，指在遭收押時對陳明文不利的陳明文證詞，是因當時檢調以交保為利誘，他才這樣說，一審認為，賴文正的確是遭以交保為利誘，才指控陳明文，不採信他的證詞，判陳明文無罪；當時嘉義縣政府水利處長的陳殿寶則遭依洩密罪判6個月，可易科罰金。
檢察官不服判決，上訴二審，全案因工程完工後衍生糾紛，要移付仲裁，因此審理5年才結案，二審台南高分院合議庭認為，陳明文洩密犯行明確，但並未涉貪汙、圖利，依洩密罪判陳明文6個月，可易科罰金18萬元。
